Επιστήμονες του Γερμανικού Κέντρου Έρευνας για τον Καρκίνο του Πνεύμονα (DZL) στην Χαιδελβέργη, σε συνεργασία με μια διεθνή ομάδα, απέδειξαν ότι η στρατηγική δοκιμών που συνιστά η Διεθνής Ένωση για τη Μελέτη του Καρκίνου του Πνεύμονα (IASLC) για τον προσδιορισμό της συγγένειας πολλαπλών εστιών όγκων για τον καρκίνο του πνεύμονα μπορεί να εφαρμοστεί αξιόπιστα στην κλινική καθημερινότητα – ακόμη και όταν διατίθενται μόνο μοριακές εξετάσεις με βάση μικρά γονιδιακά πάνελ.

Συνδυάζοντας την προσέγγιση της IASLC με μια νέα βιοπληροφορική μέθοδο, η ακρίβεια στη διάκριση μεταξύ ξεχωριστών πρωτοπαθών όγκων του πνεύμονα και ενδοπνευμονικών μεταστάσεων βελτιώθηκε σημαντικά.

Για να βοηθήσει τις ιατρικές και μοριακές παθολογικές ομάδες σε όλο τον κόσμο, η ομάδα έθεσε το εργαλείο ελεύθερα στη διάθεση του κοινού στο διαδίκτυο: www.hd-molpath.de/clonality-checker.

Για τους ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα με πολλαπλούς όγκους, ένα κρίσιμο ερώτημα είναι αν πρόκειται για ξεχωριστούς πρωτοπαθείς όγκους ή για μεταστάσεις ενός υπάρχοντος όγκου. Οι σύγχρονες μέθοδοι αλληλούχισης, οι οποίες χρησιμοποιούνται ούτως ή άλλως στο πλαίσιο της θεραπευτικής αγωγής, παρέχουν ένα γενετικό αποτύπωμα του όγκου, με το οποίο μπορούν να συγκριθούν δείγματα όγκων.

Η απάντηση έχει άμεση επίδραση στη σταδιοποίηση της νόσου και στην επιλογή της θεραπείας.

Οι κλασικές ιστολογικές μέθοδοι παραμένουν πολύτιμες, αλλά συχνά φτάνουν στα όριά τους, ειδικά όταν πρόκειται για μικρά δείγματα βιοψίας.

Για να βελτιώσει αυτό το πρόβλημα, η IASLC πρότεινε πρόσφατα έναν αλγόριθμο που συνδυάζει την παθολογική αξιολόγηση με στοχευμένες μοριακές παθολογικές εξετάσεις.

Για τους παθολόγους, τους γιατρούς και τους φυσικούς επιστήμονες υπό την καθοδήγηση του καθηγητή Stenzinger και του Δρ. Kirchner ήταν σημαντικό να ελέγξουν αν αυτή η προσέγγιση λειτουργεί αξιόπιστα και υπό συνήθεις συνθήκες, δηλαδή υπό συνθήκες όπου συνήθως διατίθενται μόνο μικρές ποσότητες ιστού και μικρότερα πάνελ αλληλουχίας.

Σε μία από τις μεγαλύτερες μέχρι σήμερα πρακτικές μελέτες, η ομάδα του Heidelberg ανέλυσε 240 δείγματα όγκων από 120 ασθενείς με μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC). Έλαβαν υπόψη ασθενείς με και χωρίς λεμφαδενικές ή απομακρυσμένες μεταστάσεις, διαφορετικούς ιστολογικούς υποτύπους καθώς και συντηρημένο (FFPE) ιστό – δηλαδή τυπικές συνθήκες της κλινικής πρακτικής.

Τα περισσότερα δείγματα εξετάστηκαν με πάνελ μόνο 31-54 γονιδίων – το πρότυπο σε πολλές ευρωπαϊκές κλινικές. Μεγαλύτερα πάνελ με πάνω από 500 γονίδια χρησιμοποιήθηκαν κυρίως μόνο όταν η αρχική διάγνωση δεν έδωσε σαφή απάντηση.

Η ομάδα ανέπτυξε ένα νέο βιοπληροφορικό εργαλείο που λαμβάνει υπόψη τη συχνότητα ή τη σπανιότητα συγκεκριμένων γενετικών μεταλλάξεων. Αυτό επιτρέπει μια πιο αξιόπιστη ταξινόμηση της κλωνικότητας. Βάση ήταν η συχνότητα των μεταλλάξεων σε μια ανεξάρτητη ομάδα αναφοράς NSCLC με 3.477 δείγματα.

Με το νέο εργαλείο, το ποσοστό των ασαφών ευρημάτων μειώθηκε σε μόλις 2 %, ακόμη και σε μικρά πάνελ.

"Η ακριβής διάκριση μεταξύ του εάν πολλαπλοί όγκοι του πνεύμονα είναι συγγενείς ή έχουν αναπτυχθεί ανεξάρτητα είναι καθοριστική για τον σχεδιασμό της θεραπείας. Αυτό το ερώτημα μας τίθεται συχνά στην καθημερινή κλινική διαγνωστική πρακτική", λέει ο Δρ Michael Allgäuer, πρώτος συγγραφέας της μελέτης.

"Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι ακόμη και με τα περιορισμένα πάνελ που είναι διαθέσιμα σήμερα σε πολλά νοσοκομεία, είναι δυνατές αξιόπιστες απαντήσεις – ειδικά με την υποστήριξη του ελεύθερα προσβάσιμου βιοπληροφορικού εργαλείου μας", προσθέτει η Δρ Martina Kirchner, η οποία είχε αναλύσει εκ νέου τα εκτεταμένα γενετικά δεδομένα.

Ιδιαίτερα σημαντικό: οι ασθενείς που ταξινομήθηκαν ως φορείς ξεχωριστών πρωτοπαθών όγκων επέζησαν σημαντικά περισσότερο από εκείνους με μεταστατική νόσο – μια σαφής απόδειξη της κλινικής σημασίας της ακριβούς ταξινόμησης.

Το ελεύθερα διαθέσιμο "Clonality Checker" από τη Χαϊδελβέργη συνδυάζει την προσέγγιση IASLC με τη νέα βιοπληροφορική μέθοδο. Έτσι, τα κλινικά και παθολογικά κέντρα σε όλο τον κόσμο έχουν στη διάθεσή τους ένα εύκολα προσβάσιμο, τεκμηριωμένο εργαλείο για τη βελτίωση της διαγνωστικής ακρίβειας – ακόμη και σε περιπτώσεις όπου οι δυνατότητες αλληλούχισης είναι περιορισμένες.

Αυτό το έργο κατέστη δυνατό χάρη στη στενή συνεργασία μιας διεπιστημονικής ομάδας παθολόγων και φυσικών επιστημόνων του Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου της Χαϊδελβέργης, καθώς και γιατρών της Θωρακοκλινικής της Χαϊδελβέργης – σε συνεργασία με εμπειρογνώμονες από την Πορτογαλία, τη Γαλλία, την Ελβετία και τις Κάτω Χώρες. Το έργο δημοσιεύθηκε στο έγκριτο περιοδικό "Journal of Thoracic Oncology".

Πηγές:
Γερμανικό Κέντρο Έρευνας για τον Καρκίνο του Πνεύμονα - Journal of Thoracic Oncology

Ειδήσεις υγείας σήμερα
Ι. Βαρδακαστάνης: Το αναπηρικό κίνημα συνεχίζει να αγωνίζεται και να διεκδικεί
Ενδυνάμωση των ασθενών: Καμπάνια ευαισθητοποίησης για την ενίσχυση υιοθέτησης της περιτοναϊκής κάθαρσης στην Ελλάδα
Πνευμονία: Βακτηριακό ένζυμο είναι πιθανό να προκαλεί μοιραίες καρδιακές επιπλοκές [μελέτη]